即将废部的轻音部，四位女生为了拯救社团，开始演奏音乐，度过美好的高中时光。
不死的新人类“亚人”被政府视为研究对象，普通高中生永井圭发现自己竟是亚人后，展开逃亡。
人类生活在被巨人包围的墙内，少年艾伦目睹母亲被吃后，发誓要驱逐所有巨人。